El lagarto gigante de La Gomera presenta las formas características de los lacértidos, una familia de morfología especialmente conservativa. En ese sentido, la cabeza se encuentra bien diferenciada del cuerpo y cubierta de grandes placas fácilmente distinguibles de las pequeñas escamas dorsales. Presentan miembros bien desarrollados, cada uno de ellos terminado en un quiridio de cinco dedos con garra. La cola es, por lo general, mucho más larga que el cuerpo (en ocasiones, sin embargo, puede perderse por autotomía), y está recubierta de escamas dispuestas en verticilos. Nunca presenta protuberancias córneas, cresta o espinas.

La escama o placa internasal es más ancha que larga y no está en contacto con la rostral. Presenta dos placas prefrontales separadas por una placa extra conocida como interprefrontal. Esta placa se encuentra casi siempre ausente en las demás especies del género, y sólo ha sido detectada en algunos individuos de Gallotia intermedia y de G. caesaris. Tiene cuatro supraoculares, de las que la anterior y la porterior son mucho más pequeñas que las otras dos. La occipital es más larga que ancha.

Sobre la boca se disponen 8 supralabiales, de las que ninguna toca el ojo. Las tres posteriores están claramente abultadas en los adultos, y presentan tonos rosados. La masetérica está bien diferenciada, mientras que la timpánica es sólo algo mayor que las demás escamas que rodean el oído.

Las escamas gulares se encuentran claramente separadas de las ventrales por la presencia de un collar. Presenta dientes monocúspides de disposición acrodonta en el pterigoides que, en los individuos actuales, se disponen siempre en una única fila. En los dentarios, maxilares y premaxilar los dientes son tricúspides y de implante pleurodonto; su número es variable, aunque siempre menor que el de otros lagartos gigantes canarios de tamaño similar; las cúspides, aunque bien definidas, suelen ser menos conspicuas que en Gallotia simonyi, G. intermedia, G. auaritae o G. goliath.

Las escamas dorsales son pequeñas, están aquilladas y se disponen en la región central del cuerpo en un número que varía entre 75 y 85. Las escamas ventrales son de gran tamaño y cuadrángulares, y se disponen en 18 series longitudinales y entre 31 y 35 transversales. Sobre los muslos se disponen entre 31 y 37 glándulas o poros femorales.

El dorso, el píleo y la cola son pardos, con variaciones estacionales determinadas por las mudas. Presentan una mancha característica blanca que cubre la región gular, la mandibula inferior y que sobrepasa ligeramente la boca; esta mancha se extiende hacia atrás hasta los oídos, y en la región ventral se extiende por el tórax. En los flancos se disponen manchas azules de hasta una docena de escamas. Las plantas de pies y manos son negras.

En la actualidad, el tamaño de los lagartos gigantes de La Gomera varía entre los 15 cm de un recién nacido (5 cm de longitud entre el hocico y la cloaca) y los 70 cm de un macho capturado en 2006 (24 cm entre el hocico y la cloaca). Se ha podido comprobar, sin embargo, mediante estudios morfométricos y secuenciación de ADN, que algunos individuos de esta especie que vivieron hace apenas unos siglos podían superar los 120 cm de longitud total (38 cm entre el hocico y la cloaca). Otros ejemplares, aparentemente de la misma especie, sobrepasaban ampliamente esta longitud.